MET703 - KALITSAL HASTALIKLARDA PROTEOMİK ve METABOLOMİK
| Dersin Adı | Kodu | Yarıyılı | Teori (saat/hafta) |
Uygulama (saat/hafta) |
Yerel Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|---|
| KALITSAL HASTALIKLARDA PROTEOMİK ve METABOLOMİK | MET703 | 2. Yarıyıl | 2 | 0 | 2 | 8 |
| Önkoşul(lar)-var ise | ||||||
| Dersin Dili | Türkçe | |||||
| Dersin Türü | Zorunlu | |||||
| Dersin verilme şekli | Yüz yüze | |||||
| Dersin öğrenme ve öğretme teknikleri | Anlatım Tartışma Soru-Yanıt Takım/Grup Çalışması Rapor Hazırlama ve/veya Sunma Deney Proje Tasarımı/Yönetimi | |||||
| Dersin sorumlusu(ları) | Prof.Dr.R.Köksal Özgül, Doç.Dr. Basri Gülbakan | |||||
| Dersin amacı | Proteomik ve metabolomik kavramları ve bu alanda yapılan teorik ve uygulamalı araştırmaların moleküler tıpta kullanım alanları, kalıtsal hastalıkların moleküler patafizyolojisinin araştırılmasında kullanılan karşılaştırmalı proteomik ve metabolomik analizleri öğretmektir | |||||
| Dersin öğrenme çıktıları |
| |||||
| Dersin içeriği | I. Metabolomik ve proteomik yöntemler ve terminoloji, II. Bu konuda yeni geliştirilen ve kullanımda olan teknikler ve metodlar konusunda genel bilgi, III. Kalıtsal hastalıkların bu yöntemlerle tanısı | |||||
| Kaynaklar | 1. Proteome Research, Two Dimensional Gel Electrophoresis and Identification Methods, Thierry Rabilloud, Springer Verlag, Berlin, Germany, 2000. 2. Purifying Proteins for Proteomics, A Laboratory Manual, Richard J Simpson, Cold Spring Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 2004 3. Introduction to Protein Structure, Carl Brenden, John Tooze, Garland Publishing, New York 1999 4. The Handbook of Metabonomics and Metabolomics, John Lindon, Jeremy Nicholson, Elanie Holmes, Elsevier, Hardbound, 2006 | |||||
Haftalara Göre İşlenecek Konular
| Haftalar | Konular |
|---|---|
| 1. Hafta | Proteombilim kavramı, amino asitler, protein yapısına giriş, protein yapı ve fonksiyonu |
| 2. Hafta | Memeli dokularından ve hücre membranından protein izolasyonu, diyaliz ve tampon değişimi, protein miktar tayini |
| 3. Hafta | Proteom ve metabolom analizleri için protein saflaştırma yöntemleri |
| 4. Hafta | Kütle spektrometri yöntemi ile protein karakterizasyonu, kotranslasyonel ve posttranslasyonel modifikasyonların tanımlanması, glikoproteinlerin analizi |
| 5. Hafta | Ara sınav |
| 6. Hafta | Proteomik ve metabolik çalışmalar için biyolojik materyal alınması,hazırlanması ve saklanması |
| 7. Hafta | Metabolom analizlerinde kullanılan farklı analitik teknik uygulamaları |
| 8. Hafta | Metabolom analizlerinde kullanılan farklı analitik teknik uygulamaları |
| 9. Hafta | Vücut sıvılarında, hücre ve dokularda hastalık teşhisi |
| 10. Hafta | Ara sınav |
| 11. Hafta | Metabolik profilleme için biyolojik veri tabanları |
| 12. Hafta | Vücut sıvılarında, hücre ve dokularda biomarker tanımlanması,hastalık teşhisi |
| 13. Hafta | Metabolik profilleme kullanılarak hastalık tanısı |
| 14. Hafta | NMR ve vücut sıvılarında kullanımı |
| 15. Hafta | NMR ve metabolik profilleme |
| 16. Hafta | Final Sınavı |
Değerlendirme Sistemi
| Yarıyıl içi çalışmaları | Sayısı | Katkı Payı % |
|---|---|---|
| Devam (a) | 0 | 0 |
| Laboratuar | 6 | 50 |
| Uygulama | 0 | 0 |
| Alan Çalışması | 0 | 0 |
| Derse Özgü Staj (Varsa) | 0 | 0 |
| Ödevler | 2 | 20 |
| Sunum | 0 | 0 |
| Projeler | 0 | 0 |
| Seminer | 0 | 0 |
| Ara Sınavlar | 2 | 10 |
| Genel sınav | 1 | 20 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı | 0 | 70 |
| Yarıyıl Sonu Sınavının Başarı Notuna Katkısı | 0 | 30 |
| Toplam | 100 | |
AKTS (Öğrenci İş Yükü) Tablosu
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi | Toplam İş Yükü |
|---|---|---|---|
| Ders Süresi | 16 | 2 | 32 |
| Laboratuvar | 10 | 2 | 20 |
| Uygulama | 0 | 0 | 0 |
| Derse özgü staj (varsa) | 0 | 0 | 0 |
| Alan Çalışması | 0 | 0 | 0 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön Çalışma, pekiştirme, vb) | 16 | 3 | 48 |
| Sunum / Seminer Hazırlama | 2 | 15 | 30 |
| Proje | 0 | 0 | 0 |
| Ödevler | 2 | 10 | 20 |
| Ara sınavlara hazırlanma süresi | 2 | 10 | 20 |
| Genel sınava hazırlanma süresi | 1 | 20 | 20 |
| Toplam İş Yükü | 49 | 62 | 190 |
Dersin Öğrenme Çıktılarının Program Yeterlilikleri İle İlişkilendirilmesi
| D.9. Program Yeterlilikleri | Katkı Düzeyi* | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |
| 1. Kalıtsal metabolik hastalıkların tanı ve tedavi monitorizasyonunda kullanılan ileri düzey analitik kimya ve moleküler genetik alanlarında laboratuvar çalışmalarını yapabilecek bilgi ve beceriye sahip bilim insanı olarak yetişir. | X | ||||
| 2. Program yeterlilikleri için gerekli olan şartları program sonunda yapmış olduğu laboratuvar çalışmaları ve ders programı sonunda elde ettiği teorik bilgiler, tez çalışması ve katıldığı uygulamalı çalışmalar sonucunda kazanır ve bağımsız araştırıcı olarak çalışmalarına devam edebilir. | X | ||||
| 3. Laboratuvar çalışmalarında biyogüvenlik kurallarına uygun çalışarak iyi laboratuvar uygulamalarını bilir ve gözetir. Kalıtsal metabolik hastalıkların tanısında kullanılan birinci basamak ve ileri düzey metabolik testler ile genetik testleri yorumlayacak temel bilgi düzeyine sahiptir. | X | ||||
| 4. Kalıtsal metabolik hastalıkların tanımlanmasında ülkemiz koşullarına uygun yeni metodolojilerin geliştirilmesini sağlar, metabolik hastalıklar ile ilgili tarama programlarının geliştirilmesi ile ilgili yöntem ve metodları geliştirebilir. | X | ||||
| 5. Biyokimyasal genetik alanında özgün araştırma planlayıp uygulayabilen donanımlı bilim adamı olarak bilgisini eleştirel şekilde sorgular, takım çalışmalarında ve bireysel çalışma hayatında etik değerlere uygun hareket eder. | X | ||||
| 6. Metabolizma çalışmaları multidisipliner araştırmaları gerektirir. Bu alan biyokimyasal genetik olarak tanımlanır ve ağırlıklı araştırma yöntemi olarak moleküler genetik, analitik kimya, biyokimya, genetik ve moleküler hücre biyolojisi alanlarının pek çok uygulamasını iç içe uygulamayı gerektirir. Program sonunda mezun bu alanların temel teorik altyapısına ve laboratuvar ve uygulamalı araştırma yapma deneyimine sahip olur. | X | ||||
| 7. Kalıtsal metabolik hastalıklar konusunda disiplinlerarası ekip çalışmasına uygun bir araştırma ve uygulama ortamında çalışır. Farklı disiplinlerin getirmiş olduğu avantajları üst üste çakıştırarak üst düzey ve bilimsel etkisi yüksek araştırmalar planlar ve uygular. | X | ||||
| 8. Moleküler metabolizma alanında uluslararası gelişmeleri ve literatürü takip eder. | X | ||||
*1 En düşük, 2 Düşük, 3 Orta, 4 Yüksek, 5 Çok yüksek