BİK702 - PROTEİN BİYOKİMYASI ve PROTEOMİK
| Dersin Adı | Kodu | Yarıyılı | Teori (saat/hafta) |
Uygulama (saat/hafta) |
Yerel Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PROTEİN BİYOKİMYASI ve PROTEOMİK | BİK702 | Herhangi Yarıyıl/Yıl | 3 | 0 | 3 | 9 |
| Önkoşul(lar)-var ise | BİK603 Temel Biyokimya: Yapılar ve Kataliz; BİK604 Temel Biyokimya: Metabolizma | |||||
| Dersin Dili | Türkçe | |||||
| Dersin Türü | Zorunlu | |||||
| Dersin verilme şekli | Yüz yüze | |||||
| Dersin öğrenme ve öğretme teknikleri | Anlatım Diğer: makale tartışmaları ve öğrenci sunumları | |||||
| Dersin sorumlusu(ları) | Prof. Dr. Ebru Bodur | |||||
| Dersin amacı | Öğrencilerin proteinlerin yapıları, saflaştırılması, yapı-fonksiyon ilişkileri, proteomik ve yapı analizleri konularında araştırma yapabilecek, güncel yayınları takip edebilecek teorik bilgi ile donanmaları hedeflenmektedir. | |||||
| Dersin öğrenme çıktıları |
| |||||
| Dersin içeriği | Protein yapı, fonksiyon ve metabolizması; yapı analizi, saflaştırma, tanımlanma yöntemleri; proteomik araştırma teknikleri konularını kapsayan teorik ders | |||||
| Kaynaklar | 1. Voet D, Voet JG, Biochemistry, 4. baskı, John Wiley & Sons, Inc. NJ, 2011 2. Advances in Protein Chemistry (süreli yayınlar serisi) 3. Simpson, R.J. Proteins and Proteomics, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2003 4. Konu ile ilgili güncel dergi makaleleri | |||||
Haftalara Göre İşlenecek Konular
| Haftalar | Konular |
|---|---|
| 1. Hafta | Amino asitler, fiziksel ve kimyasal özellikleri |
| 2. Hafta | Proteinlerin üç boyutlu yapısı |
| 3. Hafta | Proteinlerde yapı fonksiyon ilişkileri |
| 4. Hafta | Protein yapı analizi yöntemleri |
| 5. Hafta | Peptid ve proteinlerin ribozomal ve nonribozomal sentezleri |
| 6. Hafta | Proteinlerin sentez sonrası modifikasyonları |
| 7. Hafta | Proteinlerin yönlendirilmesi ve protein yıkımı |
| 8. Hafta | Sunumlar |
| 9. Hafta | Protein saflaştırma yöntemleri |
| 10. Hafta | Proteomik araştırmaları: giriş |
| 11. Hafta | İki yönlü elektroforez ve kütle spektroskopisi, sunumlar |
| 12. Hafta | Protein matriks analizi ve mikroçipler, sunumlar |
| 13. Hafta | Maya iki hibrit yöntemi ve faj gösterim yöntemi, sunumlar |
| 14. Hafta | Glikoproteomik ve fosfoproteomik, sunumlar |
| 15. Hafta | Biyoinformatik araçların proteomikte kullanımı, sunumlar |
| 16. Hafta | Genel sınav |
Değerlendirme Sistemi
| Yarıyıl içi çalışmaları | Sayısı | Katkı Payı % |
|---|---|---|
| Devam (a) | 0 | 0 |
| Laboratuar | 0 | 0 |
| Uygulama | 0 | 0 |
| Alan Çalışması | 0 | 0 |
| Derse Özgü Staj (Varsa) | 0 | 0 |
| Ödevler | 1 | 15 |
| Sunum | 1 | 35 |
| Projeler | 0 | 0 |
| Seminer | 0 | 0 |
| Ara Sınavlar | 0 | 0 |
| Genel sınav | 1 | 50 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı | 2 | 50 |
| Yarıyıl Sonu Sınavının Başarı Notuna Katkısı | 1 | 50 |
| Toplam | 100 | |
AKTS (Öğrenci İş Yükü) Tablosu
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi | Toplam İş Yükü |
|---|---|---|---|
| Ders Süresi | 14 | 3 | 42 |
| Laboratuvar | 0 | 0 | 0 |
| Uygulama | 0 | 0 | 0 |
| Derse özgü staj (varsa) | 0 | 0 | 0 |
| Alan Çalışması | 0 | 0 | 0 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön Çalışma, pekiştirme, vb) | 14 | 12 | 168 |
| Sunum / Seminer Hazırlama | 1 | 25 | 25 |
| Proje | 0 | 0 | 0 |
| Ödevler | 0 | 0 | 0 |
| Ara sınavlara hazırlanma süresi | 0 | 0 | 0 |
| Genel sınava hazırlanma süresi | 1 | 35 | 35 |
| Toplam İş Yükü | 30 | 75 | 270 |
Dersin Öğrenme Çıktılarının Program Yeterlilikleri İle İlişkilendirilmesi
| D.9. Program Yeterlilikleri | Katkı Düzeyi* | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |
| 1. Biyokimya alanında ileri düzeyde kuramsal ve uygulamalı bilgiye sahiptir ve bunları geliştirir. | X | ||||
| 2. Profesyonel etik (fikri mülkiyet hakkı, akademik dürüstlük, insan ilişkilerinde etik: ayırımcılık yapmama, liyakat, özel hayata saygı vb) ile araştırma ve yayın etiği konularını bilir ve uygular. | X | ||||
| 3. Belirli bir konuda güncel literatürdeki bilgileri derleyip analiz ederek özgün bir hipotez geliştirir ve buna dayalı proje yazar. | X | ||||
| 4. Biyokimya alanına özgü cihazlara, yöntemlere ve bilgisayar dahil diğer teknolojik araçların kullanımına ileri düzeyde hakimdir ve projeler kapsamında bunları uygular. | X | ||||
| 5. Projeye dayalı bir bilimsel çalışmayı baştan sona bağımsız olarak yürütür, sonuçlandırır, elde ettiği sonuçları uygun istatistik yöntemlerini kullanarak değerlendirir ve alanındaki ilerlemeye katkıda bulunur. | X | ||||
| 6. Alanında kanıta dayalı uygulamaları takip eder, araştırmalar yapar ve toplum yararına kullanılabilecek bilgi üretimine katkıda bulunur. | X | ||||
| 7. Yaptığı/katıldığı araştırmanın raporunu yazar, hakemli bir dergide yayımlayarak ve bilimsel toplantılarda sunarak evrensel bilgi birikimine katkıda bulunur. | X | ||||
| 8. Çalışma alanı ile ilgili bilimsel sorunlara alternatif çözümler önerebilir, yeni bilgileri eleştirel bir gözle analiz eder ve değerlendirir. | X | ||||
| 9. Yurt içi ve dışı multidisipliner çalışmalarda araştırmacı ya da lider olarak yer alır ve etkili iletişim kurarak bilimsel tartışmalarda özgün fikirlerini ifade eder ve geri bildirim verir. | X | ||||
| 10. Bir araştırma laboratuvarını tek başına idare edebilecek ve stratejik kararlar alabilecek kadar yöneticilik ve eğiticilik özelliklerine sahiptir. | X | ||||
| 11. Kendini sürekli geliştirme çabası içindedir ve yeniliklere açıktır. | X | ||||
| 12. Gerektiğinde daha önce uygulamadığı bir yöntemi kurgulayıp uygulayabilir. | X | ||||
| 13. Anadiline hakimdir, kendini düzgün bir şekilde ifade ederek ileri düzeyde yazılı, sözlü ve görsel iletişim kurar ve tartışır. | X | ||||
| 14. Alanıyla ilgili gelişmeleri takip edip sözlü / yazılı katkıda bulunabilecek düzeyde İngilizce bilir ve kullanır. | X | ||||
*1 En düşük, 2 Düşük, 3 Orta, 4 Yüksek, 5 Çok yüksek