KİM706 - BİYOMOLEKÜL KOMPLEKSLERİ ve MOLEKÜLER TANIMLAMA
| Dersin Adı | Kodu | Yarıyılı | Teori (saat/hafta) |
Uygulama (saat/hafta) |
Yerel Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BİYOMOLEKÜL KOMPLEKSLERİ ve MOLEKÜLER TANIMLAMA | KİM706 | Herhangi Yarıyıl/Yıl | 3 | 0 | 3 | 10 |
| Önkoşul(lar)-var ise | yok | |||||
| Dersin Dili | Türkçe | |||||
| Dersin Türü | Seçmeli | |||||
| Dersin verilme şekli | Yüz yüze | |||||
| Dersin öğrenme ve öğretme teknikleri | Anlatım Soru-Yanıt Rapor Hazırlama ve/veya Sunma Gösteri Uygulama-Alıştırma | |||||
| Dersin sorumlusu(ları) | Doç. Dr. Mehmet Atakay | |||||
| Dersin amacı | Kovalent olmayan etkileşimler, proteinlerin kendi aralarında ve metal, DNA gibi diğer türler ile aralarında meydana gelen etkileşimler, moleküler baskılama, antijen-antikor etkileşimleri, proteomiks, fosfoproteomiks, aptamer, aptamer-protein etkileşimleri, protein etkileşimleri analizlerinde mikroarray kullanımı, protein-DNA yapıları arasında meydana gelen etkileşimlerin çeşitli spektroskopik tekniklerle tayini konularında öğrencilerin bilgi sahibi olmasını sağlamaktır. | |||||
| Dersin öğrenme çıktıları |
| |||||
| Dersin içeriği | Protein-protein etkileşimi; Peptit-metal iyonu etkileşimi; Peptit boya etkileşimi: Peptit/protein-enzim etkileşimi; Peptid/protein-oligonükleotid/DNA etkileşimi; Antijen-antikor kompleksleri; Reseptör-ligand etkileşimleri; Amino asit/peptid/protein -siklodekstrin etkileşimi, aptamerler; Proteomiks çalışmaları, Proteinlerin enzimatik parçalanma ürünlerinin analizleri; Peptitlerin amino asit dizilimlerinin analizi; Biyomoleküllerin supramoleküler komplekslerinin karakterizasyonu; Karbonhidrat analizleri. | |||||
| Kaynaklar | Pavel Hobza P., Müller-Dethlefs K., Non-Covalent Interactions, Theory and Experiment, RSC Theoritical and Computational Chemistry Series, (2009) Komiyama M., Takeuchi T., Mukawa T., Asanuma H., Molecular Imprinting, Wiley, (2003) Downard K., Mass Spectrometry: A Foundation Course, Royal Society of Chemistry, (2004) Golemis E., Protein-Protein Interactions: A Molecular Cloning Manual, cold spring harbor laboratory press, (2001) Delaage M,. Molecular Recognition Mechanisms, Wiley, (1991) | |||||
Haftalara Göre İşlenecek Konular
| Haftalar | Konular |
|---|---|
| 1. Hafta | Kovalent olmayan etkileşimler |
| 2. Hafta | Moleküler tanımlama stratejileri |
| 3. Hafta | Protein-protein etkileşimleri |
| 4. Hafta | Protein-DNA, protein-boya, protein-metal etkileşimleri |
| 5. Hafta | Antijen-Antikor kompleksleri |
| 6. Hafta | Moleküler baskılanmış polimerler |
| 7. Hafta | Proteomiks çalışmaları |
| 8. Hafta | Biyolojik kütle spektrometrisi |
| 9. Hafta | Enzimatik parçalama, amino asit dizilim tayini |
| 10. Hafta | Ara sınav |
| 11. Hafta | Fosfoproteomiks çalışmaları |
| 12. Hafta | Aptamerler ve aptamer-protein etkileşimleri |
| 13. Hafta | Mikroarray uygulamaları |
| 14. Hafta | Biyomoleküllerin supramoleküler komplekslerinin karakterizasyonu |
| 15. Hafta | Uygulama-Alıştırma |
| 16. Hafta | Genel sınav |
Değerlendirme Sistemi
| Yarıyıl içi çalışmaları | Sayısı | Katkı Payı % |
|---|---|---|
| Devam (a) | 0 | 0 |
| Laboratuar | 0 | 0 |
| Uygulama | 2 | 5 |
| Alan Çalışması | 0 | 0 |
| Derse Özgü Staj (Varsa) | 0 | 0 |
| Ödevler | 10 | 25 |
| Sunum | 0 | 0 |
| Projeler | 0 | 0 |
| Seminer | 0 | 0 |
| Ara Sınavlar | 1 | 20 |
| Genel sınav | 1 | 50 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı | 13 | 50 |
| Yarıyıl Sonu Sınavının Başarı Notuna Katkısı | 1 | 50 |
| Toplam | 100 | |
AKTS (Öğrenci İş Yükü) Tablosu
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi | Toplam İş Yükü |
|---|---|---|---|
| Ders Süresi | 14 | 3 | 42 |
| Laboratuvar | 0 | 0 | 0 |
| Uygulama | 2 | 8 | 16 |
| Derse özgü staj (varsa) | 0 | 0 | 0 |
| Alan Çalışması | 0 | 0 | 0 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön Çalışma, pekiştirme, vb) | 14 | 6 | 84 |
| Sunum / Seminer Hazırlama | 0 | 0 | 0 |
| Proje | 0 | 0 | 0 |
| Ödevler | 15 | 7 | 105 |
| Ara sınavlara hazırlanma süresi | 1 | 20 | 20 |
| Genel sınava hazırlanma süresi | 1 | 40 | 40 |
| Toplam İş Yükü | 47 | 84 | 307 |
Dersin Öğrenme Çıktılarının Program Yeterlilikleri İle İlişkilendirilmesi
| D.9. Program Yeterlilikleri | Katkı Düzeyi* | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |
| 1. Yüksek lisansla uzmanlaşır ve alanına yenilikçi bilimsel kavramlar getirir. | X | ||||
| 2. Disiplinlerarası etkileşimi değerlendirerek karmaşık fikirleri analiz eder ve özgün sonuçlar elde eder. | X | ||||
| 3. Alanındaki yeni bilgileri önyargısız bir şekilde değerlendirir, eleştirir, yorumlar ve aktarır. | X | ||||
| 4. Alanında yeni fikirler, yöntemler ve uygulamalar geliştirir veya farklı alanlara uyarlar. | X | ||||
| 5. Alanında ileri bilgi ve tecrübesiyle farklı araştırma yöntemleriyle bilimsel stratejiler geliştirir. | X | ||||
| 6. Ulusal/uluslararası hakemli dergilerde özgün makaleler yayınlayarak bilimsel birikime katkıda bulunur. | X | ||||
| 7. Alanında liderlik yaparak özgün çalışmalar ve disiplinlerarası sorunların çözümüne katkı sağlar. | X | ||||
| 8. Yaratıcı ve eleştirel düşünme ile sorun çözme yeteneklerini kullanarak yeni düşünceler ve yöntemler geliştirir. | X | ||||
| 9. Alanında yetkin kişilerle tartışırken özgün görüşlerini savunur ve etkili iletişim kurar. | X | ||||
| 10. Yabancı dil kullanarak uluslararası kaynaklara erişir, bilgilerini günceller ve meslektaşlarıyla iletişim kurar. | X | ||||
| 11. Ulusal ve uluslararası bilimsel araştırma gruplarında çalışır. | X | ||||
| 12. Alanındaki ilerlemeleri takip eder, içselleştirir ve toplumun bilgi toplumu ve sürdürülebilirlik sürecine katkı sağlar. | X | ||||
| 13. Alanıyla ilgili veri yönetimini toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerleri gözeterek etkin ve güvenli bir şekilde yönetir. | X | ||||
*1 En düşük, 2 Düşük, 3 Orta, 4 Yüksek, 5 Çok yüksek