BYL679 - İLERİ BAKTERİ GENETİĞİ

Dersin Adı Kodu Yarıyılı Teori
(saat/hafta)
Uygulama
(saat/hafta)
Yerel Kredi AKTS
İLERİ BAKTERİ GENETİĞİ BYL679 2. Yarıyıl 3 0 3 8
Önkoşul(lar)-var ise
Dersin DiliTürkçe
Dersin TürüSeçmeli 
Dersin verilme şekliYüz yüze 
Dersin öğrenme ve öğretme teknikleriAnlatım
Tartışma
Soru-Yanıt
Gösteri
 
Dersin sorumlusu(ları)Prof. Dr. Hatice Mergen 
Dersin amacıBu ders kapsamında öğrenciler bakterilerde genetik yapı, protein sentezi, gen mutasyonları, gen ifadesinin düzenlenmesi, DNA tamir mekanizmaları, transformasyon, konjugasyon, transdüksiyon, klonlama, bakterileri araştırmada kullanılan genetik metotlar ve genetik modifikasyonları öğrenecektir.  
Dersin öğrenme çıktıları
  1. Bu dersin sonunda öğrenci; Bakteri kromozomunun yapısını, DNA, RNA, hidrofobik etkileşimler, çift sarmalın farklı formları, süper kıvrım, DNA tamir mekanizmaları, transkripsiyon, translasyon, translasyon sonrası olaylar, gen kopya sayısı, transkripsiyonal kontrol, translasyonal kontrol, bakteriyofajların genetiği, plasmidler, bakterilerde gen aktarım mekanizmaları (transdüksiyon, rekombinasyon, konjugasyon ve transformasyon),
  2. genomik plastisite, genetik modifikasyonlar, dizileme tekniği ve klonlama, bakteri sınıflandırmasında kullanılan yeni yöntemeler: mikro array ve yeni nesil DNA dizi analizi hakkında bilgi sahibi olacaktır.
  3. Bu dersin sonunda öğrenci; Bakteri kromozomunun yapısını, DNA, RNA, hidrofobik etkileşimler, çift sarmalın farklı formları, süper kıvrım, DNA tamir mekanizmaları, transkripsiyon, translasyon, translasyon sonrası olaylar, gen kopya sayısı, transkripsiyonal kontrol, translasyonal kontrol, bakteriyofajların genetiği, plasmidler, bakterilerde gen aktarım mekanizmaları (transdüksiyon, rekombinasyon, konjugasyon ve transformasyon), genomik plastisite, genetik modifikasyonlar, dizileme tekniği ve klon
Dersin içeriğiBakteri kromozomunun yapısı,
Bakterilerde replikasyon, transkripsiyon ve translasyon,
Gen ifadesinin düzenlenmesi,
Genetik materyalin transferi,
Plasmidlerin moleküler biyolojisi,
Klonlama,
Bakteri sınıflandırması,
Sınıflandırma ve mikroarray,
Sınıflandırma ve yeni nesil DNA dizi analizi,

 
Kaynaklar1.Jeremy W. Dale, Simon F. Park. Molecular genetics of bacteria. Fifth edition. Wiley-blackwell. 2010
2.Edward A. Birge. Bacterial and Bacteriophage Genetics. Fifth edition. Springer 2006.
 

Haftalara Göre İşlenecek Konular

HaftalarKonular
1. HaftaNükleik asit yapısı, DNA replikasyonu, hücre bölünmesi
2. HaftaMutasyon ve varyasyon: Mutasyon tipleri, Rekombinasyon, Mutasyonların mekanizması
3. HaftaMutasyon ve varyasyon: Mutantların izolasyonu ve tanımlanması.
4. HaftaGen ifadesinin regülasyonu: Gen kopya sayıları, transkripsiyonal kontrol, translasyonal kontrol
5. HaftaDNA tamiri ve Rekombinasyon
6. HaftaBakteriyofaj genetiği
7. HaftaAra Sınav
8. HaftaPlasmidler
9. HaftaGen transferi : Transdüksiyon, Rekombinasyon
10. HaftaGen transferi: Konjugasyon, Tansformasyon
11. HaftaGenetik modifikasyon: Suş geliştirilmesi, primer ve sekonder metabolitlerin aşırı üretimi,
12. HaftaGen klonlanması, klonlama yöntemleri, gen kütüphanesi
13. HaftaKlonlanmış genlerin üretimi, gen teknolojisinin farklı kullanım alanları
14. HaftaBakteri sınıflandırmasında genetik metotlar: mikroarray ve yeni nesil DNA sekanslama
15. HaftaFinal sınavına hazırlık
16. HaftaFinal sınavı

Değerlendirme Sistemi

Yarıyıl içi çalışmalarıSayısıKatkı Payı %
Devam (a)00
Laboratuar00
Uygulama00
Alan Çalışması00
Derse Özgü Staj (Varsa) 00
Ödevler1425
Sunum00
Projeler00
Seminer00
Ara Sınavlar125
Genel sınav150
Toplam100
Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı050
Yarıyıl Sonu Sınavının Başarı Notuna Katkısı050
Toplam100

AKTS (Öğrenci İş Yükü) Tablosu

Etkinlikler Sayısı Süresi Toplam İş Yükü
Ders Süresi 14 3 42
Laboratuvar 0 0 0
Uygulama000
Derse özgü staj (varsa)000
Alan Çalışması000
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön Çalışma, pekiştirme, vb)14342
Sunum / Seminer Hazırlama14228
Proje000
Ödevler000
Ara sınavlara hazırlanma süresi144
Genel sınava hazırlanma süresi188
Toplam İş Yükü4420124

Dersin Öğrenme Çıktılarının Program Yeterlilikleri İle İlişkilendirilmesi

D.9. Program YeterlilikleriKatkı Düzeyi*
12345
1. Biyoloji veya farklı alandaki lisans düzeyi yeterliliklerine dayalı olarak, bilgilerini uzmanlık düzeyinde geliştirir, derinleştirir ve istatistik metotları kullanarak analiz eder ve yorumlar.   X 
2. Alanında edindiği uzmanlık düzeyindeki kuramsal ve uygulamalı bilgileri kullanır.    X
3. Alanında edindiği bilgileri farklı disiplin alanlarından gelen bilgilerle bütünleştirerek yorumlar ve yeni bilgiler oluşturur.    X
4. Alanı ile ilgili karşılaşılan sorunları araştırma yöntemlerini kullanarak çözümler.   X 
5. Alanı ile ilgili uzmanlık gerektiren bir çalışmayı bağımsız olarak yürütür.   X 
6. Alanı ile ilgili uygulamalarda karşılaşılan ve öngörülemeyen karmaşık sorunların çözümü için yeni stratejik yaklaşımlar geliştirir ve sorumluluk alarak çözüm üretir.   X 
7. Alanında edindiği uzmanlık düzeyindeki bilgi ve becerileri eleştirel bir yaklaşımla değerlendirir ve öğrenmesini yönlendirir.    X
8. Alanının gerektirdiği düzeyde bilgisayar yazılımı ile birlikte bilişim ve iletişim teknolojilerini kullanır.   X 
9. Alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerleri gözetme yeteneğine sahip olur.   X 
10. Alanının gelişmesinde yer alan önemli kişileri, olay ve olguları, sonuçları dikkate alarak değerlendirir.    X

*1 En düşük, 2 Düşük, 3 Orta, 4 Yüksek, 5 Çok yüksek